O objetivo do estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana de isolados alcalifílicos obtidos de amostras de água do Lago Itaipu frente a alguns patógenos de interesse agronômico e clínico. Dois protocolos distintos foram seguidos: difusão em ágar, para leveduras e bactérias, e o teste de crescimento radial em placa, para atividade antifúngica em fungos filamentosos. Foram obtidos 16 isolados alcalifílicos, dos quais 14 seguiram para testes antimicrobianos. A maior parte da atividade antagônica foi verificada contra B. cereus. Um isolado mostrou atividade inibitória de amplo espectro contra ambas bactérias e uma levedura. Entre os isolados estudados 43% apresentou atividade antagônica. Nenhum isolado mostrou inibição contra fungos filamentosos nas condições testadas. A descoberta de novas moléculas ativas depende de exaustivos testes visando triar a diversidade microbiana dos diferentes ambientes, sendo o lago Itaipu pouco estudado neste sentido. O estudo mostrou que tal ambiente, que recebe água de rios que drenam boa parte do oeste do país, pode apresentar significativa quantidade de isolados promissores quanto à produção de moléculas de interesse. Mais estudos acerca da identificação das amostras e das moléculas por eles produzidas serão conduzidos.