A hidrogenação do óleo de soja é um processo importante na indústria alimentícia. Múltiplas reações químicas ocorrem simultaneamente à hidrogenação com diferentes constantes de velocidade efetiva (k), assim, a determinação dos mecanismos cinéticos que descrevem o processo é complexa. Além disso, a hipótese da existência de compostos intermediários de transição eleva a possibilidade de mecanismos reacionais. Coletaram-se amostras de gorduras parcialmente hidrogenadas em uma planta industrial cuja variação na concentração de C_18:3, C_18:2, C_18:1 (cis e trans) e C_18:0, obtidas por cromatografia gasosa, foram simuladas por diferentes mecanismos cinéticos descritos por um conjunto de equações diferenciais ordinárias. Obtiveram-se os valores de k para cada etapa do mecanismo através de otimização por enxame de partículas. O mecanismo com menor erro quadrático médio (1,91) considerava a presença de compostos intermediários antes da hidrogenação das insaturações. Os valores de k obtidos confirmaram a hidrogenação preferencial do C_18:3 seguida pelo C_18:2 e C_18:1 e a hidrogenação preferencial do C_18:3 e C_18:2 em relação a conversão em seus isômeros geométricos trans. O inverso ocorre para o C_18:1. Portanto, os mecanismos e metodologia propostos são úteis para simular as consequências da alteração de parâmetros de processo nas taxas de formação dos ácidos graxos durante a hidrogenação.