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Avaliação da integração de dados biológicos para a inferência de redes gênicas
Última alteração: 2018-12-03
Resumo
As redes regulatórias é um foco de pesquisa importante no ramo da biologia, com a
finalidade de descobrir os relacionamentos entre os genes e como se influenciam durante
os processos intra e intercelulares. Dependendo de onde os genes são expressados, como
são expressados e o por que da expressão, pode expor informações necessárias para o
controle da dinâmica dos sistemas biológicos viabilizando a prevenção ou tratamento
doenças. Uma das ferramentas para o desvendamento dos sistemas regulatórios dos
genes é a inferência (engenharia reversa) onde na biologia é estabelecido que um
organismo é determinado pela sua expressão gênica. Contudo a inferência sofre com a
maldição da dimensionalidade no qual há um número pequeno de dados e uma grande
dimensão nas amostras dificultando a pesquisa. Para diminuir os erros causados pela
maldição da dimensionalidade umas das propostas é a integração de dados biológicos
com técnicas computacionais sendo essencial na predição de GRNs (Gene Regulatory
Networks) e suas respectivas funções. Com o propósito de criar tal otimização na
inferência das redes regulatórias, este trabalho projeta a criação de um protótipo de
integração de dados públicos acessíveis na internet estruturando ao máximo os dados
biológicos relevantes.
finalidade de descobrir os relacionamentos entre os genes e como se influenciam durante
os processos intra e intercelulares. Dependendo de onde os genes são expressados, como
são expressados e o por que da expressão, pode expor informações necessárias para o
controle da dinâmica dos sistemas biológicos viabilizando a prevenção ou tratamento
doenças. Uma das ferramentas para o desvendamento dos sistemas regulatórios dos
genes é a inferência (engenharia reversa) onde na biologia é estabelecido que um
organismo é determinado pela sua expressão gênica. Contudo a inferência sofre com a
maldição da dimensionalidade no qual há um número pequeno de dados e uma grande
dimensão nas amostras dificultando a pesquisa. Para diminuir os erros causados pela
maldição da dimensionalidade umas das propostas é a integração de dados biológicos
com técnicas computacionais sendo essencial na predição de GRNs (Gene Regulatory
Networks) e suas respectivas funções. Com o propósito de criar tal otimização na
inferência das redes regulatórias, este trabalho projeta a criação de um protótipo de
integração de dados públicos acessíveis na internet estruturando ao máximo os dados
biológicos relevantes.
Palavras-chave
Inferência; Redes Gênicas; Integração de Dados