Portal de Eventos Científicos da UTFPR (EVIN), XXIV Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica da UTFPR

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Busca, Indexação e definição de base de dados integrada de Escherichia Coli
Douglas Ribeiro Violante, Fabrício Martins Lopes

Última alteração: 2020-05-21

Resumo


Este trabalho adota dados provenientes da base de dados da KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), devido a sua divisão hierárquica em vias metabólicas e descrições interespécies para calcular a similaridade semântica entre quaisquer genes G1 e G2 de organismos modelos, como a Escherichia Coli, Drosophila Melanogaster, Saccharomyces Cerevisiae e Arabdopsis Thaliana. Foi desenvolvido um script que pode ser descrito em duas partes, a primeira parte trata da geração do grafo acíclico direcionado, e a segunda parte trata do cálculo da similaridade baseada em similaridade semântica. Os scripts permitem que futuramente poderá ser levada em conta informações como os termos GO (Gene Ontology) e KO (KEGG Orthology), atualmente introduzidos e considerados, podendo assim elevar a precisão do cálculo.

Palavras-chave


Bioinformática; Integração de Dados; Escherichia Coli

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