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Simulação de males amiloidogênicos com software PHAST
Última alteração: 2020-09-20
Resumo
Os peptídeos beta amiloides Aβ1-40 (PDB: 2lfm) induzem doenças neurodegenerativas, como o Mal de Alzheimer (AD), pela formação de agregados amilóides depositados no cérebro de pacientes. Acredita-se também que a amilina humana (hIAPP), hormônio produzido com a insulina pelas células β-pancreáticas, agrega-se no pâncreas e assim contribuir para o surgimento da Diabetes Tipo 2 (T2D). Dessa forma, drogas análogas à hIAPP, como Pramlintide (PM), foram biotecnologicamente desenvolvidas sob inspiração de mamíferos resistentes à T2D, como roedores (rIAPP) e porcos (pIAPP). Dados clínicos revelam uma inter-relação entre o aumento de T2D em portadores de AD, deste modo, visamos estudar a interação molecular que leva à agregação de isoformas da proteína hIAPP (sIAPP, rIAPP e pIAPP) com Aβ1-40 por meio do software PHAST. O software PHAST simula paralelamente cadeias heteropoliméricas com o método de Monte Carlo multicanônico empregando um modelo (AB) coarse-grained de proteínas, descrevendo-as de acordo com a hidrofobicidade dos aminoácidos (A: hidrofóbico e B hidrofílico). Os resultados são analisados com o módulo PHAST-ANALYST, descrevendo termostatisticamente os sistemas à la Boltzmann.
Palavras-chave
Monte Carlo; Agregação; Diabetes; Mal de Alzheimer.
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