A análise de redes complexas permite obter conclusões sobre diversos aspectos das comunidades ecológicas, como robustez e estabilidade e conservação de espécies, contribuindo para inferências do impacto humano sobre ecossistemas. Este estudo verificou a estrutura e variação temporal da interação entre macrófitas flutuantes e invertebrados aquáticos no Lago de Itaipu por meio da análise de redes complexas. Foram realizadas quatro coletas trimestrais entre abril e dezembro de 2017 em 10 bancos de macrófitas às margens do Refúgio Biológico de Santa Helena, Santa Helena, PR. Dois indivíduos de cada espécie de macrófita foram coletados em cada banco, ensacados e levados ao laboratório para lavagem e pesagem das raízes e verificação dos invertebrados aquáticos associados. Quatro matrizes de interação macrófitas-invertebrados foram construídas para verificação da estrutura da rede por meio de métricas de redes complexas. Foram coletados 72.394 invertebrados associados a 230 raízes de oito espécies de macrófitas. A rede de interação macrófitas-invertebrados teve baixos valores de aninhamento e de especialização demonstrando o padrão generalista da interação. Os resultados demonstraram a estrutura e complexidade das interações macrófitas-invertebrados aquáticos e a diversidade de relações estabelecidas, bem como a existência de fatores que influenciam na variação da interação entre esses dois grupos.