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A dinâmica molecular é um processo que descreve o comportamento dos átomos e moléculas em função do tempo, a simulação desse processo no presente trabalho será realizada com auxílio do pacote GROMACS, onde analisaremos três variações do segmento RBM encontrado na proteína spike do vírus SARS-Cov-2. Para preparação do sistema, centralizamos a proteína em uma caixa e definimos suas dimensões com 2,0nm entre as imagens periódicas da proteína e a tratamos como célula unitária. Em seguida realizamos a adição de íons e a minimização de energia garantindo que não houvesse choque estéricos no sistema, passando para as fases de equilíbrio que se dividiu em duas etapas, NVT (Número constante de partículas, volume e temperatura) e NPT (Número de partículas, pressão e temperatura). Após finalizar as fases de equilíbrio, as restrições de posição são liberadas e a produção da dinâmica molecular é executada para coleta de dados para análise.