O objetivo deste trabalho foi identificar isolados de fungos previamente isolados por microbiologia convencional pelo seqüenciamento da região ITS do DNA ribossômico. MÉTODOS: os isolados (n = 10) foram cultivados em Sabouraud Glucose Agar, com antibióticos, a fim de evitar a contaminação bacteriana. O DNA foi isolado usando o método CTAB. O DNA obtido foi amplificado por reação de PCR, em seguida, purificado. A qualidade e a quantidade do DNA obtido foram avaliadas por eletroforese em 0,8% de gel de agarose com coloração por brometo de etidio. Finalmente, o DNA foi sequenciado. RESULTADOS: Todos os géis de eletroforese apresentaram os resultados esperados para a técnica aplicada. Um total de 10 isolados de fungos foram identificados após análise das sequências obtidas. Através dos arquivos que foram enviados de volta pela empresa de sequenciamento. CONCLUSÕES: o uso de ferramentas moleculares permitiu a identificação dos microrganismos estudados.