As bactérias do gênero Bacillus possuem inúmeras aplicações biotecnológicas. O intuito do presente trabalho foi realizar a bioprospecção através do isolamento e identificação molecular de bactérias do gênero Bacillus do solo. A princípio o experimento foi conduzido com a seleção de três isolados bacterianos (2AA, 2AC e 2AF), obtidos a partir de uma amostra de solo de plantio de milho da cidade de Toledo – Paraná. As amostras foram cultivadas em meio LB líquido por 48 horas e o DNA extraído por fervura. Posteriormente, ocorreu a análise do gene 16S rRNA por meio da reação em cadeia da polimerase (PCR). Por fim, as amostras foram sequenciadas e analisadas. Os resultados das análises das sequências revelou similaridade de 100% entre as amostras 2AC e 2AF, apresentando identidade genética com espécies do grupo do Bacillus subtilis e o 2AA apresentou 100% de identidade genética com amostras de Bacillus megaterium. Com base nos resultados obtidos nesse trabalho é possível ter uma noção das diversas aplicações biotecnológicas das bactérias isoladas e podendo assim ser direcionado a pesquisas futuras.